Nella Cina del XVI secolo, la Confraternita degli Assassini è stata completamente spazzata via dall'Imperatore. L'assassina Shao Jun è però decisa a ricrearla e per questo inizia un lungo viaggio che la porterà fino in Mongolia, sulle tracce di un vecchio nemico che si dice abbia ottenuto un prezioso manufatto. Una nuova e appassionante avventura per Shao Jun, personaggio visto in giochi, cortometraggi e manga legati all'incredibile universo di Assassin's Creed.